Tendo obtido vitórias milagrosas em uma série de batalhas contra o Exército Britânico, Lelouch Lamperouge levou os Cavaleiros Negros, sua organização paramilitar, a um estado mais poderoso do que nunca. Nada parece impossível para ele quando utiliza sua força militar, seu intelecto e o poder de seu Geass. No entanto, os obstáculos diante da revolta nunca cessam, as habilidades de combate de Kururugi Suzaku e o aparecimento de uma criança misteriosa chamada V.V. ameaçam acabar com a grande rebelião de Lelouch.
O adolescente Kyle Moore enfrenta dificuldades para se ajustar à nova escola. Os valentões não saem da sua cola, e a garota dos seus sonhos parece ser inalcansável. Mas, quando lhe apresentam um aplicativo que promete realizar todos os seus desejos, a vida do novato muda da água para o vinho.
A estratégia perversa de um pai para identificar o assassino de seu filho envolve um experimento científico cujas consequências são sentidas pelas gerações vindouras.